韩斌

韩斌,1963年4月出生,安徽庐江人,研究员,中科院上海生命科学研究院副院长。2018年1月8日,获得2017年度国家自然科学奖一等奖。

人物简介

  韩斌(1963.4-),安徽庐江人,研究员。现为中国科学院国家基因研究中心主任;中科院上海生命科学研究院植物生理生态所副所长;科技部863生物领域专家组成员,主持多项国家重大科研项目。

  1988年7月从广西大学农学院毕业,获分子遗传学硕士学位;获得英国Gatsby Charitable Foundation奖学金,于1989年2月赴英国著名的John Innes中心Sainsbury 实验室攻读博士学位,从事植物病原菌分子遗传学研究。1992年11月获英国塞理斯伯里实验室约翰英纳斯中心博士学位。1998年8月,正值中国水稻基因组测序计划起步阶段,毅然回国工作。从2002年起,担任了中国科学院上海生命科学研究院植物生理与生态研究所副所长。2008年,被任命为中科院北京基因组研究所副所长。 2011年12月2日任中科院上海生命科学研究院副院长。

  回国后,韩斌带领中心全体研究人员,出色完成国际水稻基因组计划 粳稻第四号染色体的精确测序任务,并取得多项重要的创新性研究成果。作为国内首次完成大基因组单条染色体的精确测序,这是我国在生物领域基础研究上的重大突破,具有深远的学术意义和经济前景。该成果也被两院院士评为2002年全国”十大”科技新闻榜首之一。

  韩斌研究员长期从事基因组学的基础研究,并致力于利用不断发展的基因组学的理论和方法探索水稻基因组结构、功能和遗传改良潜力。完成了对水稻第四号染色体的精确测序和综合分析,发展了籼、粳稻全基因组及基因水平上的比较与功能研究系统,建立了以第二代测序仪为基础的高通量基因型分析平台和转录组分析平台。有关研究结果先后发表在Nature, Genome Research, Plant Cell等国际知名学术刊物上。

个人简历

  1981-1985 安徽师范大学生物系 学士

  1985-1988 广西农学院分子遗传学研究室 硕士

  1985-1986 华东师范大学生物系(联合培养) 硕士

  1989-1992英国John Innes Centre 博士

  1992-1998英国剑桥大学植物科学系 博士后

  1998-至今中国科学院国家基因研究中心 主任,水稻基因组测序工作专家组组长

  2002-至今中国科学院上海生科院植物生理生态所 副所长

  2008-2011中国科学院 北京基因组研究所 副所长

  2011-至今中国科学院上海生命科学研究院副院长

所获奖项

  1、2003年3月,韩斌博士获得由中国科学院精神文明建设领导小组颁发的:首届“中国科学院创新文化建设先进个人”光荣称号。

  2、2003年3月19日,上海生命科学研究院国家基因中心和遗传与发育生物学研究所,由中国科学院授予“中国科学院2001-2002年度重大创新贡献团队”称号。

  3、2003年4月,中科院国家基因研究中心由共青团上海市委员会命为2001-2002年度上海市新长征突击队。

  4、2003年9月,中央组织部、人事部、中央宣传部、教育部、中央统战部和科学技术部授予韩斌博士 “留学回国人员成就奖”。

  5、2003年12月28日,我中心的“水稻基因组第四号染色体测序及分析”项目获得上海市科学技术进步奖一等奖,排名第一。

  6、2004年1月,韩斌博士荣获上海市优秀留学回国人才称号。

  7、2004年4月,韩斌博士被评为2001-2003年度上海市劳动模范。

  8、2004年10月,韩斌博士荣获“中国科学院优秀研究生指导教师”称号。

  9、2006年,被列入“上海市领军人才培养计划”。

  10、2007年12月,获得国家自然科学奖二等奖。

11、2018年1月8日,2017年度国家科学技术奖励大会在人民大会堂开幕,韩斌凭借参与的水稻高产优质性状形成的分子机理及品种设计,获得2017年度国家自然科学奖一等奖。

学术成果

  韩斌研究员主要的研究方向是水稻基因组测序、比较基因组学研究和水稻功能基因组学研究。在过去的几年里,他和他的实验室构建了水稻四号染色体的物理图谱,并在此基础上完成了水稻四号染色体的精细测序和分析,同时开发了覆盖水稻四号染色体的芯片并用它鉴定了四号染色体上基因的表达模式。以上的这些成果发表在《自然》、《基因组研究》和《植物细胞》等杂志上。在最近的几年里,他和他的实验室开始利用新一代测序技术开发高通量的基因分型平台和转录组分析平台,并在此基础上研究水稻基因组的遗传变异,进行重要农艺性状相关基因的遗传定位,系统分析和鉴定水稻基因的转录本及表达模式。以上的这些成果发表在《自然遗传学》和《基因组研究》等杂志上。在韩斌研究员获得过多项奖项和荣誉中,最主要的是2007年国家自然科学二等奖。

  1. 水稻4号染色体精细物理图的构建及基因组精确测序

  通过整合分子标记、克隆末端序列、DNA指纹等数据,运用分子、染色体荧光原位杂交和比较基因组分析的方法,构建了粳稻4号染色体高精确度和高覆盖率(98.7%)的物理图。鉴定了4号染色体的物理长度以及物理图距和遗传图距的对应关系。基于染色体精细物理图,采用克隆连克隆法的基因组测序方法,完成水稻4号染色体的精确测序和分析。研究成果发表在2002年11月21日出版的Nature上。

  之后继续承担了水稻全部12条染色体着丝粒序列和结构的分析,以及籼、粳稻全基因组序列比较,直到2005年国际水稻基因组测序计划完成。

  2. 水稻4号染色体结构及功能的深入研究

  在精细物理图构建和精确测序的基础上,突破了拼装高度重复序列的技术难题,成功鉴定了覆盖着丝粒区域的大片段克隆,完成了序列测定和组装。发现水稻4号染色体着丝粒核心区是由近360个高度重复的特异序列组成,并将这些重复序列组装成18个串联式重复区段,还在该区域鉴定一些编码基因。

  在精确测序的基础上,研制了水稻4号染色体的覆瓦式排列的特异芯片,并通过芯片杂交分析,开展了籼、粳稻基因比较表达谱分析和转录调控因子的研究。鉴定了水稻4号染色体上一批新的表达基因,比较了籼粳基因功能和调控方面的差异。得出了水稻染色体上相邻排列的基因有很高的协同表达调控特征等重要结论。还印证了之前对4号染色体基因分布规律的推测结果。

  3. 比较基因组和功能基因组研究

  通过对籼、粳稻基因组的比较分析,系统鉴定了籼粳之间序列多态性分布和频率。随着水稻基因组精确测序的完成,建立水稻转基因实验室,建设了一定规模的温室和试验田。高通量研究水稻基因功能,对一万多条籼稻全长cDNA进行了克隆,测序和分析。同时,通过比较基因组学研究了转座子突变可能对水稻基因功能分化产生的影响。结合基因家族的比较分析和表达组、转基因、过表达等功能分析,发现了一系列在水稻抗热,抗旱和抗盐生理过程中起重要作用的基因。

  4. 建立以第二代测序仪为基础的高通量功能基因组研究平台

  最近,新一代DNA测序方法的诞生标志着生命科学技术的又一次飞跃,为大规模发现和利用水稻遗传资源开辟了有效的新途径。这种新方法集低时耗、高性价比、高密度和高精度等众多优点于一身。采用这一方法完成了一组籼、粳稻重组自交系的基因型鉴定,与目前广泛应用的分子标记相比,新方法在速度和精度上有了大大提高。其精度是之前传统的方法手段无法实现的。

  同时尝试的高通量功能基因组研究的新技术还包括表达组和染色质免疫沉淀测序。迅速、大量地鉴定覆盖全基因组的单核苷酸多态性,全面深入掌握我国水稻资源的遗传多样性。

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