用途不同：二元母猪一般是做种用，主要是用来繁育商品代肥猪，老了淘汰后经检疫合就能卖肉，寿命在3年以上。三元母猪一般是育肥卖肉，6个月就可以出栏，寿命很短。
生产性能不同：一个合格的猪场，二元母猪的MSY一般是在22头以上，如果换成三元母猪，MSY就在12-18头，2胎以后产仔数量会明显出现减少。
一、二元母猪和三元母猪有什么区别
1、用途不同
（1）二元母猪主要是种用，用来繁育商品代肥猪，老了淘汰后经检疫合格，定点屠宰以后可以卖肉，寿命在3年以上。
（2）三元母猪主要是育肥卖肉，6个月出栏，寿命很短，体重在115公斤左右，可以阉割，也可以不阉割。
2、生产性能不同
（1）一个合格的猪场，二元母猪的MSY（一头母猪一年提供的出栏肥猪数量）在22头以上，至少能产五六胎仔猪，种用时间长。
（2）如果换成三元母猪，MSY在12-18头，2胎以后产仔数量显著减少，而且发情不明显，种用价值大幅降低，需要淘汰。
3、价格不同
二元母猪的价格要高三元母猪高很多，目前二元母猪的价格在4600元/头左右，三元母猪价格在3000-4000元/头。
二、二元猪和三元猪的特点
1、三元猪和二元猪都是通过不同品种的猪来杂交而产生的，它们的根本区别在杂交猪的数量上。三元猪是三个不同品种杂交的猪，这三个品种一般是长白公猪、大白母猪和杜洛克公猪。二元猪是两个不同的品种而杂交的猪，通常是用长白公猪与东北明猪进行杂交。
2、相比而言，三元猪要比二元猪的杂交效果好，可以提高它们的瘦肉率。但无论是什么品种的猪仔，饲养员都需要进行合理的管理，来促进它们的生长。
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